ظلت عمادة شؤون الطلاب ترعى أمر شهداء الجامعة منذ الأيام الأولى حفظاً لحقوقهم ، وبلغ عدد شهداء جامعة الخرطوم منذ العام 1990 وحتى 2003 93 شهيدا ً من شتى بقاع السودان ، ومن كليات الجامعة المختلفة .لذلك كان تأسيس وحدة الشهداء في العام 1995 .
أهداف الوحدة:
- تكريم أسر الشهداء وربطهم بالأسرة الجامعية .
- توثيق سير الشهداء العطرة .
- ربط الجيل الحالي بأسر الشهداء وتفعيل روح الجهاد .
- تقديم نموذج للمؤسسات الأخرى في العمل الخدمي والتكافلي وتقديم المساعدات .
مهام الوحدة :
تقوم الوحدة بالمهام الآتية:
- تقوم الوحدة بالتعاون مع كليات الجامعة المختلفة .لعمل مسح ميداني لأسر الشهداء للوقوف على أحوالهم الاجتماعية والاقتصادية.
- تقوم الوحدة حسب الخطة المجازة بتقديم دعم سنوي وعمل وبرامج للتواصل مع أسر الشهداء حسب مناسبات الأعياد والمناسبات الاجتماعية .
- القيام بزيارات لأسر الشهداء على أن تشرك الكلية ومنظمة الشهيد وإدارة الجامعة وبعض المهتمين في الزيارات .
- المساهمة في تسهيل العمليات الإدارية الممكنة في إجراءات أسر الشهداء لدى الجهات المعنية وتقديم الدعم المعنوي في ذلك .
5/ تسهيل مهمة أبناء الشهداء في إجراءات الجامعة .
6/ مشاريع إنتاجية لأسر الشهداء .